+66 2 5646700 Ext 71441 | noc.th@nstda.or.th
![National Omics Center](https://nstda.or.th/noc/wp-content/uploads/2022/10/Logo-NOC.png)
ศูนย์โอมิกส์แห่งชาติ
![National Omics Center](https://nstda.or.th/noc/wp-content/uploads/2022/10/Logo-NOC.png)
ศูนย์โอมิกส์แห่งชาติ
Ceriops decandra
Genome assemblies Post Date : 18/10/2022
Local name: โปรงขาว
Location: Ranong, Thailand
Method: 10x assembly + RagTag scaffolding
Assembly level: Chromosome
BioProject: PRJNA734119
Genome sequence: JAHLGO000000000
Annotation Data (Download): gff3, CDS, Protein
Publication:
![](https://nstda.or.th/noc/wp-content/uploads/2023/09/CD_circos.png)
Genomic landscape ของโปรงขาว (Ceriops decandra); (I) physical map ของจีโนมโปรงขาวทั้ง 18 โครโมโซม เรียงลำดับตามขนาดของโครโมโซม (Mb); (II) ความหนาแน่นของลำดับเบสซ้ำ (Repeat density) บนแต่ละโครโมโซม; (III) ความหนาแน่นของยีน (Gene density) บนแต่ละโครโมโซม; (VI) ค่า GC content บนแต่ละโครโมโซมแสดงด้วยค่าร้อยละของเบส G และเบส C; (V) Syntenic regions ในจีโนมโปรงขาว
![](https://nstda.or.th/noc/wp-content/uploads/2023/09/CD-map.jpg)
แผนที่แสดงการกระจายตัวของประชากรโปรงขาว (Ceriops decandra) ในประเทศไทย; สัญลักษณ์วงกลมแสดงสัดส่วน Admixture ของโครงสร้างประชากรย่อย; (สีเขียว) โครงสร้างประชากรย่อยที่มาจากบรรพบุรุษฝั่งอ่าวไทย; (สีน้ำเงิน) โครงสร้างประชากรย่อยที่มาจากบรรพบุรุษฝั่งอันดามัน
![](https://nstda.or.th/noc/wp-content/uploads/2023/09/CD_chloroplast-1024x1024.png)
Chloroplast genome
Accession: NC_061406.1
Type: circular
Length: 166650 bp
คำอธิบายภาพ: แผนภาพ Chloroplast genome ของโปรงขาว (Ceriops decandra) โดยวงนอกสุดแสดงตำแหน่งที่ตั้งของยีนบน Chloroplast genome ยีนที่แสดงอยู่ด้านนอกของวงจะถูกถอดรหัสในทิศตามเข็มนาฬิกา ส่วนยีนที่อยู่ด้านในจะถูกถอดรหัสในทิศทวนเข็มนาฬิกา โดยยีนที่อยู่ใน functional group ที่ต่างกันจะแสดงด้วยสีที่ต่างกัน; แถบสีเทาเข้มแสดงค่า GC content ส่วนแถบสีเทาอ่อนแสดงค่า AT content ของจีโนม